ECO.GIF (10555 bytes)

ECOLOGIA MICROBIANA MOLECULAR

Pertanyent al Grup de Recerca: Ecologia Microbiana Molecular(GRCT 02)                                                    

Institut d’Ecologia Aquàtica, Universitat de Girona. 

Campus de Montilivi. E-17071 Girona, Spain

Telèfon: 34 972 41 82 66    Fax: 34 972 41 81 50

 

                           

 

 

 

MEMBRES (PERSONAL ACADÈMIC)

 

COGNOMS NOM CATEG. TEL.

(+34 972 41+

E-MAIL

ABELLA AMETLLER

CARLES

CU

8176

carles.abella@udg.es

BAÑERAS VIVES

LUIS

TU

8177

lluis.banyeras@udg.es

BORREGO MORE

CARLES

TU

8177

carles.borrego@udg.es

CALIZ GELADOR

JOAN

Becari

8261

joan.caliz@udg.es
GICH BATLLE FREDERIC

Investigador

C-RED

 8177 frederic.gich@udg.es

LLIRÓS DUPRÉ

MARC

Becari

8396

marc.lliros@udg.es

MONTSERRAT BUENO

GENOVEVA

Associat

8261

genoveva.montserrat@udg.es
PRAT BOTANCH CHANTAL  Becària   chantal.prat@udg.es

RUIZ RUEDA

OLAYA

Becària

8396

olaya.ruiz@udg.es
TRIADO MARGARIT XAVIER Associat 8261 xavier.triado@udg.es

VILA PORTELLA

XAVIER

TU

8176

xavier.vila@udg.es

COL.LABORADORS

COGNOMS NOM CATEG. TEL.

(+34 972 41+

E-MAIL
MAURICIO LAIA Tècnica laboratori 9225 laia.mauricio@udg.es
PLACENCIA ANNA      
SÁNCHEZ MELSIÓ ALEXANDRE Becari 8396 alexsanchezmelsio@yahoo.es

 

 

 

LÍNIES DE RECERCA

 

 

 

 

 

 

 

  

1  Archaea mesòfils en ecosistemes aquàtics: ecologia microbiana i impacte en el cicle biogeoquímic del Carboni

Estudi de la diversitat, dinàmica, activitat metabòlica i impacte biogeoquímic de les poblacions d’Archaea en ecosistemes aquàtics temperats amb l'objectiu d'esbrinar tant la seva diversitat com el paper ecològic dins l'ecosistema. El treball experimental es basa en tècniques moleculars (fingerprinting genètic del 16S rDNA i de gens funcionals, FISH, clonatge, etc.), bioquímiques (estudi de biomarcadors lipídics) i d'ecologia microbiana, on es combinen els estudis in situ de diferents ambients naturals amb experiments fisiològics (incubacions amb radiotraçadors de Carboni i tècniques de stable isotope probing) i el disseny de noves estratègies d'enriquiment i aïllament.  Aquesta investigació es realitza en col·laboració amb el Centre d'Estudis Avançats de Blanes (CEAB-CSIC) i el Nederlands Instituut voor Onderzoek der Zee (NIOZ) holandès.

 

2  Ecologia microbiana i ecofisiologia dels Bacteris Verds del Sofre

Estudi de la diversitat de Bacteris Verds del Sofre en ambients aquàtics hipersalins, mitjançant tècniques moleculars basades en el 16S rDNA i metodologies clàssiques d’enriquiment, aïllament i cultiu. Determinació de la capacitat d’osmorregulació de les diferents molècules utilitzades per aquests bacteris per tolerar salinitats elevades. Anàlisi de la distribució i abundància dels Bacteris Verds del Sofre en sediments de llacs estratificats, com a possibles reservoris per a la colonització de l'ambient planctònic. Ecologia molecular de les comunitats bentòniques (tapissos microbians) de Bacteris Verds del Sofre. Estudi dels gens implicats en la síntesi de bacterioclorofil.les i utilitat per analitzar la diversitat bacteriana.

 

3  Bacteris oxidadors d’amoni en aigües residuals: diversitat, dinàmica poblacional i utilitat per a l’eliminació de Nitrogen

Diversitat i dinàmica de les poblacions de diferents tipus de bacteris oxidadors d’amoni que tenen utilitat en enginyeria ambiental: AOB (Nitrosomonas i altres), NOB (Nitrospira i altres), Anammox (Brocadia i altres). Utilització de tècniques moleculars (DGGE, FISH, real-time PCR) per a la seva detecció, identificació i quantificació. Monitoratge d’aquestes poblacions bacterianes en cultius enriquits, fermentadors, plantes pilot i reactors experimentals dissenyats per a l’eliminació de Nitrogen en el tractament d’aigües residuals i lixiviats d’abocadors, en relació amb la seva activitat i el funcionament dels sistemes respectius. En col.laboració amb el Laboratori d’Enginyeria Química i Ambiental de la Universitat de Girona.

 

4  Comunitats microbianes en sistemes de tractament d’aigües residuals: diversitat funcional, ecofisiologia i relació amb els cicles del Nitrogen

Determinació de la influència de la vegetació macrofítica (bàsicament balca i canyís) de les llacunes del sistema d’aiguamolls construïts SAC-EDAR-Empuriabrava per al tractament terciari d’aigües residuals, associat al sistema hídric del parc natural dels aiguamolls de l’Empordà, en les taxes de nitrificació i desnitrificació. Amb aquesta finalitat es combinen tècniques avançades de determinació molecular amb mesures convencionals d’activitat potencial utilitzant models controlats de laboratori. Els estudis han de contribuir a la gestió eficient del sistema de tractament a partir de les determinacions cinètiques.

 

5  Indicadors ecotoxicològics de contaminació i agents bacterians útils per a la bioremediació en comunitats microbianes de sòls mediterranis

Aproximació, a partir de tècniques moleculars, al coneixement de la diversitat i dinàmica de les comunitats bacterianes en sòls mediterranis tractats experimentalment amb contaminants, en relació amb el comportament dels sòls i la seva activitat. Detecció d’espècies o grups bacterians sensibles, útils com a indicadors ecotoxicològics per als diferents tipus de contaminants, així com de les espècies resistents, potencialment útils per a la bioremediació i restauració de sòls. En col.laboració amb investigadors del Departament de Productes Naturals, Biologia Vegetal i Edafologia de la Universitat de Barcelona.

 

6  Diversitat microbiana en els productes de la indústria del suro i implicació en el desenvolupament de desviacions sensorials.

Estudi de les comunitats de bacteris i fongs presents en el suro, que contribueixen de forma significativa al desenvolupament de desviacions sensorials que es poden traslladar a begudes com ara el cava o el vi. Caracterització precisa dels microorganismes presents en els taps de suro en diferents fases del procés de fabricació i estudi de la seva incidència en la producció o eliminació de compostos orgànics com ara clorofenols i cloroanisoles. En col.laboració amb el grup de recerca en Química Analítica i Ambiental de la Universitat de Girona.

 
 
 
 

 

 

 

Projectes d'Investigació

últims 10 anys

 

Projectes Europeus
Any Títol Investigador Responsable Entitat finançadora
1996-2001

Green Bacterial Photosynthesis: Structure, function, and regulation of  light-harvesting systems and core-complexes.

Ref.: ERB 4061 PL 95-1330

 Jesus Garcia-Gil (Coordinador Nacional) Comunitat Europea.     Training and Mobility of Researches (TMR)

 

Projectes Nacionals

Any Títol Investigador Responsable Entitat finançadora
2006-2009 Biodiversidad y función biológica de crenarchaeota en ecosistemas acuáticos e implicación en los ciclos de nitrógeno y el carbono. REf. CGL2006-12058-C02-01/BOS Carles Borrego Ministerio de Ciencia y Tecnología
2006-2009 Ventajas de la utilización de macrófitos en la transformación de nitrógeno en sistemas de humedales de tratamiento (SHT) mediante la actividad de la microbiota epifítica del tallo y la rizosfera Ref. CGL2006-02382/HID Lluís Bañeras Ministerio de Ciencia y Tecnología
2003-2006

 Efectos de distintos tipos de contaminantes sobre las comunidades microbianas en suelos. Indicadores ecotoxicológicos microbianos y bacterias de interés para bioremediación y restauración de suelos. Ref: REN2003-09513-C02-02/GLO

  Carles Abellà Ministerio de Ciencia y Tecnología
2003-2006  Diversidad de microorganismos Archaea en ecosistemas acuáticos templados. Dinámica, actividad metabólica e impacto en el ciclo biogeoquímico del carbono. Ref. REN2003-08333-C02-01/GLO Carles Borrego Ministerio de Ciencia y Tecnología
2003-2006 Diversidad funcional y ecofisiología de las bacterias transformadoras del nitrógeno  y aplicación a la gestión de un sistema de humedales de tratamiento (EDAR-Empuriabrava). Ref: REN2003-02185/HID Jesus Garcia Ministerio de Ciencia y Tecnología
2001-2003 Composición y actividad de las comunidades microbianas en un sistema de humedales de tratamiento. Aplicación a la gestión de recursos hídricos destinados a los ecosistemas acuáticos de un parque natural. Ref. REN2000-0640/HID Jesus Garcia Ministerio de Ciencia y Tecnología
2000

Composición microbiana bentónica y evaluación experimental de los procesos microbianos que afectan al ciclo de los nutrientes en lagunas costeras sometidas a fluctuaciones hídricas y entrada pulsátil de nutrientes. Ref. HID99-1137-C03-03

Jesus Garcia

Ministerio de Ciencia y Tecnología

1999-2002

Desarrollo de un método de diagnóstico de la respuesta de la comunidad nitrificante a variaciones en los parámetros ambientales. Integración de la información proporcionada en un sistema supervisor del proceso. Ref.BIO99-1014-C02-01

Carles Abellà CYCIT
1996-1999

Análisis molecular de las comunidades bacterianas asociadas a los procesos de nitrificación y desnitrificación. Aplicación a la mejora del funcionamiento de las plantas de tratamiento de aguas residuales. Ref. BIO96-1229-C02-01

 Carles Abellà CYCIT
1995-1998

Funcionamiento de ecosistemas acuáticos anaeróbicos y su incidencia sobre los ciclos de nutrientes. Elementos para una adecuada gestión de las aguas epicontinentales.          Ref. AMB95-0323

 Jesus Garcia CYCIT

 

Grup d'Investigació de Qualitat

Any Títol Investigador Responsable Entitat finançadora
2005-2008 Ajuts a Grups de Recerca Consolidats (SGR 2005):Ecologia microbiana molecular. Núm. Expedient: 01067

 

Carles Abellà

 

 Dursi-Agaur. Generalitat de Catalunya
2001-2004

Ajut per potenciar els grups d'investigació de qualitat. Ref. 2001SGR 00292.

Grup d'investigació consolidat.

Nom del grup: Ecologia Microbiana Molecular.  Ref. UdG: GRCT02

 Carles Abellà  Generalitat de Catalunya
1999-2001

Ajut per potenciar els grups d'investigació de qualitat. Ref. 1999SGR 00334.

Grup d'investigació consolidat.

Nom del grup: Ecologia Microbiana Molecular.  Ref. UdG: GRCT02

Carles Abella

 Generalitat de Catalunya

1995-1996

Ajut per potenciar els grups d'investigació de qualitat. Ref. 1995SGR 00227

 Carles Abella  Generalitat de Catalunya

 

Xarxes Temàtiques

Any Títol Investigador Responsable Entitat finançadora
2006-2004  

Genòmica ambiental Microbiana. Ref: 2004XT 00012

 

 Inv. responsable: E.O.Casamayor (CSIC)

Carles Borrego(UdG)

  Generalitat de Catalunya
 

2000-2002

 

 

Microbiologia dels ambients aquàtics anaeròbics. Ref: 2000XT 00071

 

  

Carles Abella

 

  

Generalitat de Catalunya

 

1996-1997

  Microbiologia dels ambients aquàtics anaeròbics. Ref: 1996XT 00026

Carles Abella

 Generalitat de Catalunya

 

 

Convenis/Contractes

últims 10 anys

 
Any Títol Investigador Responsable Entitat finançadora

2005-2007

 

Contracte de col.laboració científica

 

Lluís Bañeras

AECORK (Associació d'Empresaris Surers de Catalunya)

2003

 

Contracte de col.laboració científica

 

Lluís Bañeras

Tapones y Especialidades del Corcho (T.E.S.A)

 

 

 

 Publicacions

últims 10 anys

 

 

  • Ruiz-Rueda o, R Trias, L Bañeras, LJ Garcia-Gil.2007.Long term stability of denitrifiers in the bulk sediment of a constructed wetland as revealed by the analysis of nirS gene. FEMS Microbiology Ecology. Submitted

  • Trias R, L Bañeras, E Badosa, E Montesinos.2007.Bioprotection of fresh fruit and vegetables against foodborne bacterial pathogens by lactic acid bacteria. Postharvest Biology and Technology. Submitted

  • Gich Frederic & Jörg Overmann. 2006. Sandarakinorhabdus limnophila gen. nov., sp. nov., a novel bacteriochlorophyll a-containing, obligately aerobic bacterium isolated from freshwater lakes. International. Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56: 847-854.

  • MONTSERRAT, G., MARTÍ, E., SIERRA.J., GARAU, M.A.& CRUAÑAS, R.2006. Discriminating inhibitory from enhancing effects in respirometry assays from metal polluted-sewage sludge amended soils. Applied Soil Ecology, 34: 52-61.

    •

  • Calvo L., Cortey M., García-Marín J.L. and García-Gil L.J. 2005.Polygenic analysis of ammonia oxidizing bacteria strains using 16S rDNA, amoA and amoB. Int. Microbiol. 8(2): 103-110.

    •

  •  Gich Frederic, Karin Schubert, Herbert Hoffelner, Alke Bruns and Jörg Overmann. 2005. Specific detection, isolation and characterization of selected, previously uncultured members of freshwater bacterioplankton. Applied and Environmental Microbiology 71(10):5908-5919.

    •

  • CALVO, L., L.J.GARCIA-GIL.2004. Use of amoB as a new molecular marker for ammonia-oxidizing bacteria. Journal of Microbiological Methods 57: 69– 78.

  • CALVO, L.,  X. VILA, C. A. ABELLA, L.J. GARCIA-GIL. 2004.  Use of the ammonia-oxidizing bacterial-specific phylogenetic probe Nso1225 as a primer for fingerprint analysis of ammonia-oxidizer communities. Appl. Microbiol Biotechnol.,63: 715–721.

  • MARESCA, J.A., A.G.MAQUEO CHEW, M. ROS PONSATÍ, NIELS-ULRIK FRIGAARD, J. G. ORMEROD, D.A. BRYANT. 2004. The bchU gene of Chlorobium tepidum encodes the C-20 methyltransferase in Bacteriochlorophyll C biosynthesis. Journal of Bacteriology. 186 (9): 2558-2566.

  • GARCIA-GIL, L.J., F.GICH & X. FUENTES-GARCIA.2003. A comparative study of bchG from green photosynthetic bacteria. Archives of  Microbioly, 179: 108-115.

  • GICH, F., R.L.AIRS, M. DANIELSEN, B.J.KEELY , C.A.ABELLA, L.J.GARCIA-GIL, M.MILLER & C.M. BORREGO.2003. Characterization of the chlorosome antenna of the filamentous anoxygenic phototrophic bacterium Chloronema strain UdG9001. Archives of Microbiology, 180 (6):417-426.

  • SERRA, T., X. VILA, M. SOLER, J. COLOMER. 2003.Spatio-temporal heterogeneities of a planktonic Thiocystis minor population derived from a laser in situ particle analyzer. Freshwater Biology, 48: 698-708.

  • AIRS, R.L., C.M. BORREGO, L.J. GARCIA-GIL & B.J. KEELY. 2002. Identification of the Bacteriochlorophyll homologs of Chlorobium phaeobacteroides strain UdG6053 grown at light limitation. Photosynthesis Research,70: 221-230.

  • Arellano, J.B., T.B. Melø, C.M. Borrego and K.R. Naqvi. 2002. Bacteriochlorophyll e monomers, but not aggregates, sensitize singlet oxygen: Implications for a self-photoprotection mechanism in chlorosomes. Photochem. Photobiol. 76(4): 9–16.

  • Camacho,A., E. Vicente, L.J. Garcia-Gil, M.R. Miracle, M.D. Sendra, X. Vila, C.M. Borrego.2002. Factors determining changes in the abundance and distribution of micro-, nano- and picoplanktonic phototrophs in Lake El Tobar (Central Spain). Verhandlungen International Verein. Limnologie (28): 613-619

  • GLAESER. J., L. BAÑERAS, H. RÜTTERS, J. OVERMANN. 2002. Novel bacteriochlorophyll e structures and species-specific variability of pigment composition in green sulfur bacteria. Archives of microbiology, 177: 475-485.

  • Jakub Pšencík, Ying-Zhong Ma, Juan B. Arellano, L.J. García-Gil, Alfred R. Holzwarth, Tomas GILLBRO . 2002. Excitation energy transfer in chlorosomes of Chlorobium phaeobacteroides strain CL1401: the role of carotenoids. Photosynthesis Research: 71: 7-18.

  • MARTINEZ, A., J.B. ARELLANO, C.M. BORREGO, C. LOPEZ-IGLESIAS, F. GICH & L.J. GARCIA-GIL. 2002.Determination of the topography and biometrics of chlorosomes by Atomic Force Microscopy. Phot. Research., 71: 83-90.

  •  VILA, X., R. GUYONEAUD, X.P. CRISTINA, J.B.FIGUERAS & C.A.ABELLA 2002. Green sulfur bacteria from hypersaline Chiprana Lake (Monegros, Spain): habitat description and phylogenetic relationship of isolated strains. Photosynthesis Research 71: 165-172.  

  • ARELLANO, J., C.M. BORREGO, A. MARTÍNEZ-PLANELLS, T. GILLBRO &  L.J. GARCIA-GIL. 2001. Effects of carotenoid deficiency on cells and chlorosomes from Chlorobium phaeobacteroides.  Arch. Microbiol., (175): 226-233.

  • Gich, F., C.M. Borrego, A. Martínez-Planells, D.B. Steensgaard, J. Garcia-Gil & A. Holzwarth. 2001. Variability of the photosynthetic antenna of a Pelodictyon clathratiforme population from a freshwater holomictic pond. FEMS Microbiology Ecology 37: 11-19.

  • Gich, F., J.L. Garcia-Gil & J. Overmann. 2001. Previously unknown and phylogenetically diverse members ot the green nonsulfur bacteria are indigenous to freshwater lakes. Archives of Microbiology 177: 1-10.

  • GUYONEAUD, R., C. M. BORREGO, A. MARTINEZ-PLANELLS, E.T. BUITENHUIS  & L.J. GARCIA-GIL. 2001. Light response of the green sulfur bacterium  Prosthecochloris aestuarii: changes in the morphology, the  ultrastructure, and the photosynthetic antenna pigment composition. Arch.  Microbiol., (176): 278-284.

  • Serra,T., J. Colomer, X.P. Cristina, X.Vila, J.B. Arellano, X. Casamitjana. 2001. Application of a laser in situ scattering and transmissometry probe for estimating the concentration of phytoplankton, Chromatiaceae and inorganic particles in freshwater lakes. Journal of Environmental Engineering, 127: 1023-1030.

  •  VILA, X & C.A.ABELLA. 2001. Light-harvesting adaptations of planktonic phototrophic micro-organisms to different light quality conditions. Hydrobiologia 452: 15-30.

  • ABELLA, C.A., V.N: IVANOV, I.S. KIM & G.F. DONCEL. 2000. Labelled  trinucleotides as quantitative probes to identify Bacillus spp. using  fluorescent in situ hybridization. Mollecular and Cellular Probes, 14: 89-93.                                          

  • ABELLA, C.A., V.N. IVANOV & I.S. KIM. 2000. Number of triplets in 16S rRNA gene related with pathogenicity of Bacillus spp. and  Clostridium spp. J. Theor. Biol. 205:581-586.

  • ARELLANO, J.B., J. PSENCIK, C.M. BORREGO, Y-Z MA, R. GUYONEAUD, J.  GARCIA-GIL, & T.  GILLBRO. 2000. Effect of carotenoid biosynthesis inhibition on the chlorosomal organisation in  Chlorobium phaeobacteroides.  Photochem & Photobiol 71(6) 715 -723.

  • ARELLANO, J.B., THOR BERNT MELØ, CARLES M. BORREGO, L.J.  GARCIA-GIL AND K. RAZI NAQVI. 2000. Nanosecond Laser Photolysis Studies Of Chlorosomes And Artificial Aggregates Containing  Bacteriochlorophyll E: Evidence For The Proximity Of Carotenoids And  Bacteriochlorophyll A In Chlorosomes From Chlorobium phaeobacteroides  Strain Cl1401. Photochem & Photobiol. 72(5) .

  • BAÑERAS L., J. RODRIGUEZ-GONZÁLEZ & L.J. GARCIA-GIL.2000. Evaluation of soluble phophate as a factor determining the growth of sulfur photosynthetic bacteria in an eutrophic holomictic lake. Verh. Int. Verein. Limnol., 27:850-853.

  • CASAMAYOR, E.O., H. SCHÄFER, BAÑERAS, L., PEDRÓS-ALIÓ, C. MUYZER, G.2000. Identification of and Spatio-temporal Differences between Microbial Assemblages from Two Neighboring sulfurous Lakes: Comparison by Microscopy and Denaturing Gradient Gel Electrophoresis. Applied and Environmental Microbiology: 66(2): 499-508.

  • CRISTINA, X.P., X.VILA, C.A. ABELLA & L. BAÑERAS. 2000. Anoxygenic phototrophic sulfur bacteria in lake Montcortès (Spain): the deepest reported population of Chromatium s.p. Ver. Int. Verein. Limnol., 27 (2): 854-859. 

  • GARCIA-GIL, L.J., BAÑERAS L., J. RODRIGUEZ-GONZÁLEZ & C.M. BORREGO. 2000. Are phototrophic sulphur bacteria phosphate-limited? Verh. Int. Verein. Limnol., 27:840-844.

  • GICH, F., E. AMER, J.B: FIGUERAS, C.A. ABELLA, M.D: BALAGUER & M.  POCH. 2000. Assessment of microbial community structure changes by  amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA). Int. Microbiol.  3(3):103-106.

  • STEENSGAARD, D.B., C.A. VAN WALREEE, H. PERMENTIER, L. BAÑERAS,  C. M. BORREGO, J. GARCIA-GIL, J. AMESZ, A. R. HOLZWARTH, 2000. Fast energy transfer between BChl d nd BChl c  revealed in chlorosomes of the green sulfur bacterium Chlorobium  limicola. Biophysica and Biochimica Acta 1457, 71-80.

  • ABELLA, C.A., VOLODYMYR N. IVANOV & IN S. KIM. 1999. Taxon- Specific Content of Oligonucleotide Triplets in 16S rRNAs of Anoxygenic Phototrophic and Nitriying Bacteria. Journal of Theor. Biol.196: 289-296.

  • BAÑERAS L., J. RODRIGUEZ-GONZÁLEZ & L.J. GARCIA-GIL.1999. Contribution of photosynthetic sulfur bacteria to the alkaline phosphatase activity in anoxic aquatic ecosystems. Aquatic Microbial Ecology, 18: 15-22.

  • BAÑERAS L., C.M. BORREGO & L.J. GARCIA-GIL.1999.Growth-rate-dependent bacteriochlorophyll c/d rate in the antenna of Chlorobium limicola strain UdG6040. Archives of Microbiology, 171: 350-354.

  • BORREGO, C.M., L. BAÑERAS & L.J. GARCIA-GIL. 1999. Temporal variability of Chlorobium phaeobacteroides antenna pigments in a meromictic karstic lake. Aquatic Microbial Ecology,17: 121-129.

  • BORREGO,C.M., J.B.ARELLANO, C.A.ABELLA, T.GILLBRO & J.GARCIA-GIL. 1999. The molar extinction coefficient of bacteriochlorophyll e and the pigment stoichiometry in Clorobium phaeobacteroides. Photosynthesis Research 60, 257-264.

  • BORREGO, C.M., P.D.GEROLA, M.MILLER & R.P.COX. 1999. Light intensity effects on pigment composition and organisation in the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum. Photosynthesis Research, 59: 159-166.

  • GARCIA-GIL, L.J., VICENTE, E. CAMACHO, A. BORREGO, C.M. VILA, X. CRISTINA,X.P.RODRIGUEZ-GONZÁLEZ,J. 1999. Vertical distribution of photosynthetic sulphur bacteria linked to saline gradients in lake “El Tobar”(Cuenca,Spain). Aquatic Microbial Ecology, 20 (3): 299-303.

    •

  • STEENSGAARD, D.B., C.A. VAN WALREE, H. PERMENTIER, L. BAÑERAS, C.M. BORREGO, L.J. GARCIA-GIL, J. AMESZ AND A. HOLZWARTH. 1999. Fast energy transfer between BChl d and BChl c revealed in chlorosomes of the green sulfur bacterium Chlorobium limicola. Biochimica et Biophysica Acta 44808:1-10.

  • STEENSGAARD, D.B., C.A. VAN WALREE, L. BAÑERAS, C. M. BORREGO, L.J. GARCIA-GIL & A. HOLZWARTH. 1999 Evidence for spatially separate bacteriochlorophyll c and bacteriochlorophyll d pools within the chlorosomal aggregate of Chlorobium limicola. Photosynthesis research. 59: 231-241.

  • BAÑERAS, L., J. RODRÍGUEZ-GONZÁLEZ & L.J. GARCIA-GIL. 1999. Contribution of photosynthetic sulfur bacteria to the alkaline phosphatase activities in anoxic aquatic ecosystems. Aquatic Microbial Ecology. 18:15-22.

  • VILA, X. & C.A. ABELLA.1999. Spectroradiometric identification of phototrophic microorganisms in planktonic aquatic environments. Aquatic Microbial Ecology, 20 (3): 225-230.

  • VILA, X., X.P. CRISTINA, C.A. ABELLA, J.P. HURLEY. 1999. Effects of gilvin on the composition and dynamics of metalimnetic communities of phototrophic bacteria in freshwater North-American lakes. Journal of Applied Microbiology, 85: 138S-50S.

  • ABELLA, C.A., X.P.CRISTINA, A. MARTINEZ, I. PIBERNAT, X. VILA. 1998. Two new motile phototrophic consortia: Chlorochromatium lunatum and Pelochromatium selenoides. Arch. Microbiol. , 169: 452 - 459.

  • BAÑERAS, L., GARCIA-GIL, L.J. 1998. Environmental and physiological factors affecting the uptake of phosphate by Chlorobium limicola.  Arch. Microbiol,170: 252-258.

  • BORREGO, C.M., L.J. GARCIA-GIL, X.P. CRISTINA, X. VILA, & C.A. ABELLA. 1998. Occurrence of new BChl d forms in natural populations of green photosynthetic sulfur bacteria. FEMS Microbiology Ecology, 26: 257 - 267.

  • BAÑERAS, L., C. M. BORREGO & L.J. GARCIA-GIL. 1998. Changes in the antenna pigment composition of Chlorobium limicola growing in a continuous culture. In: G. Garab (ed) Photosynthesis: mechanisms and Effects. Vol I, pp: 173-176.

  • GICH, F., C.M. BORREGO, A. MARTÍNEZ-PLANELLS & L.J. GARCIA-GIL. 1998. Adaptation of the Photosynthetic antenna of BChl d containing bacteria to low light intensities. In: G. Garab (ed) Photosynthesis: mechanisms and Effects. Vol I, pp: 165-168.Kluwer Academic Publishers, Dordretch.

  • GUYONEAUD, R., A. MARTÍNEZ-PLANELLS, E.T. BUITENHUIS, C. M. BORREGO & L.J. GARCIA-GIL.1998. Light-dependent morphological and physiological changes in Prosthecochloris aestuarii. In: G. Garab (ed) Photosynthesis: mechanisms and Effects. Vol I, pp: 177-180.

  • STEENSGAARD, D.B., C.A. VAN WALREE, L. BAÑERAS, C. M. BORREGO, L.J. GARCIA-GIL & A. HOLZWARTH. 1998. Structure and function of chlorosomes of Chlorobium limicola UdG6040 containing both BChl c and BChl d In: G. Garab (ed) Photosynthesis: mechanisms and Effects. Vol I, pp: 101-104.

  • VILA, X. C.A. ABELLA, J.B. FIGUERAS, J.P. HURLEY. 1998. Vertical models of phototrophic bacterial distribution in the metalimnetic microbial communities of several freshwater North-American kettle lakes. FEMS Microbiology Ecology, 25: 287 - 299.

  • GARCIA-GIL, L.J. 1997. Un año de Microbiología SEM en Internet. Microbiologia SEM.. 13(4): 517-522

  • GICH, F. Y L.J. GARCIA-GIL. 1997. Efecto del potencial redox sobre la velocidad de reducción de los nitratos. Estudio de este proceso en el decantador secundario de una EDAR. Tecnología del Agua, 161: 51 - 56.

  • MARTÍNEZ, A., I. PIBERNAT, J. FIGUERAS & L.J. GARCIA-GIL. 1997. Structure and composition of freshwater microbial mats from a sulfurous spring (“Font Pudosa”, NE Spain). Microbiología SEM , 13: 45 - 56.

  • BORREGO, C.M., L.J. GARCIA-GIL, X. VILA, X.P. CRISTINA, J.B. FIGUERAS, C.A. ABELLA. 1997. Distribution of bacteriochlorophyll homologs in natural populations of brown-colored phototrophic sulfur bacteria. FEMS Microbiology Ecology, 24: 301 - 309.

  • FIGUERAS, J., L.J. GARCIA-GIL & C.A. ABELLA. 1997. Phylogeny of genus Chlorobium based on 16S rDNA sequence. FEMS Microbiol. Letters, 152: 31 - 36.

  • PIBERNAT, I.V.& C.A.ABELLA. 1997. Characterisation of the bacterium Chlorobium limicola external envelope using electron microscopy. Microscopy and Analysis: 29-30.

  • ZHOU, J., DAVEY, M.E., FIGUERAS, J., RIVKINA, E., GILICHINSKY, D., TIEDJE, J.M. 1997. Phylogenetic diversity of a bacterial community determined from Siberian tundra soil DNA. Microbiology, 143: 3913 - 3919.

  • BAÑERAS, L. & L.J. GARCIA-GIL. 1996. Role of photosynthetic microbial populations on the phosphorus exchange through the oxic anoxic boundary in a meromictic eutrophic lake. Arch. Hydrobiol., 48: 171 - 181.

  • BRUNET, R.C. & L.J. GARCIA-GIL. 1996. Sulfide-induced dissimilatory nitrate reduction to ammonia in anaerobic freshwater sediments. FEMS Microbiology Ecology, , 21: 131 - 138.

  • GARCIA-GIL, L. J., X.CASAMITJANA & C. A. ABELLA. 1996. Comparative study of two meromictic basins of lake Banyoles (Spain) with sulphur phototrophic bacteria. Hydrobiologia., 319: 203-211.

  • GICH, F. y L.J. GARCIA-GIL. 1996. Influencia del potencial redox en la desnitrificación en fangos activos de una EDAR. Tecnología del agua.

  • PIBERNAT, I.V. & C.A. ABELLA. 1996. Sulfide pulsing as the controlling factor of spinae production in Chlorobium limicola strain UdG 6038. Arch. Microbiol, 165: 272 - 278.

  • VILA, X., J. COLOMER & L.J. GARCIA-GIL. 1996. Modelling espectral irradiance in freshwater in relation to phytoplankton and solar irradiance. Ecological Modelling, 87:59-68.

  • VILA, X., M. DOKULIL, L.J. GARCIA-GIL, C.A. ABELLA, C.M. BORREGO & L. BAÑERAS. 1996. Composition and distribution of phototrophic bacterioplankton in the deep communities of several central European lakes: The role of light quality. Arch. Hydrobiol., 48: 183 - 196.

  • BORREGO, C.M. & L.J. GARCIA-GIL. 1995. Rearrangement of light harvesting bacteriochlorophyll homologues as a response of green photosynthetic bacteria to low light intensities. Photosynthesis Research, 45: 21-30.

  • BORREGO, CM. y L.J. GARCIA-GIL. 1995.Photosynthetic oxidation of MnS and FeS by green sulfur bacteria. Microbiologia SEM,11: 351-358.

  • Verdú, N., I. Triola, C. Borrego Y L.J. Garcia-Gil. 1995. Efecte d’una mescla estival episòdica en la dinàmica i estructura de la comunitat de microorganismes fotosintétics planctònics a l’estanyol d’en Sisó. Scientia gerundensis, 21: 71-84.

  • BORREGO, C.M. & L.J. GARCIA-GIL. 1994. Separation of bacteriochlorophyll homologues from green photosynthetic sulfur bacteria by reversed-phase HPLC. Photosynthesis Research  41: 157-163.

  • BORREGO, CM. y L.J. GARCIA-GIL. 1994. Caracterización limnológica de La Coromina, una laguna hipereutrófica del sistema lacustre de Banyoles. Limnética: 10(1): 43-51.

  • PIBERNAT, I. V. y C.A. ABELLA. 1994. Efecto de la intensidad y calidad de la luz en el desarrollo de bacterias fototróficas verdes del azufre en una columna experimental de laboratorio. Limnetica, 10: 137-142.

  • VILA, X. &  C.A. ABELLA. 1994. Effects of light quality on the physiology and the ecology of planktonic green sulfur bacteria in lakes. Photosynthesis Research  41: 53-65.

 

 

TREBALLS D´INVESTIGACIÓ

últims 10 anys

 

TESIS DOCTORALS.

 

títol: A study on the phylogeny and the ecology of ammonia oxidizing bacteria using a new molecular marker based on the gene amoB

doctoranda: Laia Calvó Perxas

director: Jesus Garcia.

data de lectura: 12 de maig de 2005

 

títol: Estudi dels carotenoides en espècies marrons de bacteris verds del sofre: diversitat, ecofisiologia i regulació

doctoranda: Noemí Mallorquí

director: Jesus Garcia.

data de lectura: 2003

 

títol: Ecologia i caracterització pigmentària de bacteris fotosintètics amb nous tipus de BCl d.

doctorand: Frederic Gich Batlle.

director: Jesus Garcia-Gil.

data de lectura: 5 de juny de 2001.

 

títol: Ecologia microbiana de bacteris fototròfics. Els consorcis fotosintètics. Aplicacions de la citometria de flux.

doctorand: Xavier Cristina Pau.

director: Carles Abellà Ametller.

data de lectura: 2000.

 

títol: Estudi de la diversitat del gen del 16S rRNA en bacteris verds del sofre. Aplicacions en taxonomia i ecologia microbiana.

doctorand: Jordi Figueres Bosch.

director: Jesus Garcia i Carles Abellà.

data de lectura: 10 de juny de 1999.

 

títol: Ecologia i fisiologia dels bacteris fototròfics del sofre en relació amb el cicle del fòsfor.

doctorand: Lluís Bañeras.

director: Jesus Garcia.

data de lectura: 20 de març de 1997.

 

títol: Aplicació de tècniques de restauració en la llacuna del Vilar: Dilució i desnitrificació. Estudi dels processos implicats.

doctorand: Ramon Brunet.

director: Carles Abella.

data de lectura: 6 de març de 1997.

 

titol: Ecologia microbiana de poblacions de bacteris fototròfics en el plàncton lacustre: la distribució espectral de la llum en la selecció entre espècies de diferent composició pigmentària.

doctorand: Xavier Vila.

director: Carles Abella.

data de lectura: 18 de desembre de 1996.

 

títol: Heterogeneïtat pigmentària en bacteris fotosintètics verds. Fisiologia i significació ecològica.

doctorand: Carles Borrego.

director: Jesus Garcia.

data de lectura: 15 de novembre de 1996.

 

títol: Ecologia microbiana dels bacteris verds del sofre. Diversitat i Fisiologia de  Chlorobium sp.

doctoranda: Imma Pibernat.

director: Carles Abella.

data de lectura: 22 de febrer de 1996.